1、 提高土壤肥力，減少化肥用量，改善作物品質

由于微生物肥料可以提高 土壤的養分含量、增強植物營養 及水分的吸收。因此在相同地力水平的土壤上可以減少化肥的用量，并且獲得等效的增產效果。使用微生物肥料可以提高 農產品品質，如蛋白質、糖、維生素等含量的提高。

2、分泌生長激素

 許多微生物各類在生物繁殖過程 中產生對植物有益代謝產物，如生長素，吲哚乙酸，赤霉素，多種維生素，氨基酸等等，能夠刺激和調節作物生長，使植物生長 健壯，營養良好，進而達到增產的效果。

3、增強植物抗病蟲和抗旱能力

  多種微生物可以誘導植物的過氧化物酶，多酚氧化酶，苯甲氨酸解氨酶，脂氧合酶，幾丁質酶等參與植物防御效應，利于防病抗病，有的微生物種類還能產生抗菌素類物質，有的則是形成了優勢種群，降低了作物病蟲害的發生。菌根真菌由于在植物根部的大量生長，其菌絲除可為植物提供營養元素外，還可增加水分吸收，有利于提高植物的抗旱能力。

4、作基肥：大田作物每畝施用40-120公斤，在春、秋整地時農家肥一起施入；經濟作物的設施栽培作物根據當地種植習慣可酌情增加用量。

5、作追肥：與化肥相比，生物有機肥的營養全、肥效長、但生物有機肥的肥料比化肥要慢一點。因此，使用生物有機肥做追肥時應比化肥提前7-10天，用量可按化肥做追肥的等值投入。

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